Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5OP48047 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms