Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AFMP43652 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AFMP43652 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AFMP43652 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AFMP43652 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AFMP43652 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AFMP43652 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AFMP43652 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms