Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGIRP43119 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms