Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms