Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZEB1P37275 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZEB1P37275 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZEB1P37275 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms