Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP214P35658 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP214P35658 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms