Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN6P29350 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms