Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms