Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLK3P07288 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLK3P07288 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms