Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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