Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms