Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA8SH3BPF8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms