Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms