Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAPRE3Q9UPY8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms