Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms