Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALPQ9UBC7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GALPQ9UBC7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms