Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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