Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms