Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCC2Q9HCC0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms