Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms