Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms