Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms