Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB2BQ9BVA1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms