Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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