Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms