Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ECSITQ9BQ95 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms