Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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