Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms