Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms