Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MVB12AQ96EY5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms