Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms