Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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