Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms