Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC50Q8IVM0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms