Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF550Q7Z398 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF550Q7Z398 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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