Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms