Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms