Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms