Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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