Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms