Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP2Q16527 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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