Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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