Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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