Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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