Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms