Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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ITGA9Q13797 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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ITGA9Q13797 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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