Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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