Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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