Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms