Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms